为提高各级疾控机构传染病预警工作的效率，进一步提高基层及时发现和识别传染病暴发的能力，初步实现传染病暴发的早期自动预警，根据国家和自治区关于传染病自动预警工作有关要求，我市已经全面开展了传染病自动预警工作。
　　“传染病自动预警信息系统”是“中国疾病预防控制信息系统”平台中的一个全新的子系统，该系统通过特定的算法确定预警阈值，当现时的病例数高于该阈值时，可自动发出预警信号，以便疫情监测与相应专业人员及时采取相应分析、核实、调查与防控措施。
　　预警系统每晚24点开始对当日全国报告的法定传染病进行自动运算，将探测到的异常结果于次日早上8点，向相应的疾控机构负责预警工作的值班人员发出手机短信预警信号。发现特殊病种单个病例时，系统将实时向设定该预警病种的本级及辖区内相关疾控机构负责预警工作的值班人员发出手机短信预警信号。
　　我市各级疾控机构负责疫情管理的预警工作人员共26人，正式启动预警信息系统以来，疫情管理人员在收到预警信息后，都能够及时核实分析，并登陆“传染病自动预警信息系统”填报《异常信息卡》和调查报告，及时完成自动预警的应答和应急信息报送工作。截止6月26日,全市共接到预警信息80条，涉及12个旗县区，预警传染病有甲肝、丙肝、戊肝、麻疹、猩红热、流行性腮腺炎、风疹、腹泻病和其它感染性病等16种，都得到了及时报告和有效控制。